Table 1 Genes used to create phenotype definition

Up-regulated

   ABCC4

chr13q32

   AMACR

chr5p13.2-q11.1

   MIPEP

chr13q12

   PRC1

chr15q26.1

   SMS

chrXp22.1

Down-regulated

   ANXA2

chr15q21-q22

   ARHGDIB

chr12p12.3

   ASS

chr9q34.1

   BHLHB2

chr3p26

   CD74

chr5q32

   CSPG2

chr5q14.3

   CUTL1

chr7q22.1

   CX3CL1

chr16q13

   FHL2

chr2q12-q14

   FLNA

chrXq28

   GATA3

chr10p15

   GBP2

chr1p22.2 I

   ER3

chr6p21.3

   IRF1

chr5q31.1

   KRT7

chr12q12-q13

   LY6E

chr8q24.3

   MMP7

chr11q21-q22

   MYL9

chr20q11.23

   SERPINB1

chr6p25

   TOP2B

chr3p24

   WFDC2

chr20q12-q13.2